不同類型的流感病毒具有不同的表面抗原，科學家發現，不同流感病毒的表面抗原差異很大，但是表面抗原中含有一種重要的表面蛋白質“神經胺酸酶(Neuraminidase)”，這種神經胺酸酶的活性中心(蛋白質的三級結構)在不同流感病毒中卻是相同的。當病毒利用宿主細胞完成複制以后，神經胺酸酶會協助病毒從宿主細胞釋放出來，同時幫助病毒穿透呼吸道的黏膜細胞，來感染其他健康的細胞，當神經胺酸酶遭到抑制，病毒的複制及感染能力就會受到限制。

克流感的主要成份是“Oseltamivir”，它是一種神經胺酸酶的抑制劑，也就是克流感的立體結構與神經胺酸酶的活性中心相同，所以會互相結合，造成神經胺酸酶失去活性，使受感染的宿主細胞所制造出來的新病毒無法釋放出來，因此可以阻止流感病毒的複制與擴散，由于神經胺酸酶的活性中心在不同流感病毒中是相同的，所以克流感對A型及B型流感病毒都有效果，可以使病患提早三天恢復正常體能，同時使病狀減輕大約40%以上。

 

不過由于流感病毒的種類很多，而且病毒是活的又會變種，2008年歐洲與美國陸續出現對克流感具有抗藥性的A型H1N1流感病毒，而且抗藥比例逐漸增加，造成克流感的效果變差。